Yûki et Zero tentent de déjouer l'attentat contre une école que préparent les terroristes prétendant servir le roi des vampires. Alors que Zero est kidnappé, Maria et Yûki font face à un ennemi inattendu. Dans le même temps, le directeur de l'Académie Cross, Kaien Kurosu, est pris dans une émeute entre vampires et humains.